2026

Science

• 人工智能如何重塑蛋白质工程

J. Agric. Food Chem.

• 基于蛋白质工程策略的酶学性质改造研究进展

ACS Cent. Sci.

• 从Prompt到Drug：走向药物研发超级智能

Chem. Commun.

• 肽–蛋白质对接：从基于物理的模型到生成式智能

Angewandte Chemie International Edition

• 基于人工智能大模型加速催化新材料研发

The Innovation Drug Discovery

• 计算驱动范式在靶向多肽药物设计中的演进：从预测建模到生成式人工智能及临床转化

Advanced Materials

• 材料信息学：AI 时代从萌芽到自主发现
• 先进人工智能技术如何塑造药物—药物与药物—靶点相互作用建模

Biochemistry

• AI设计肽在生物化学中的工具化应用

Chemical Reviews

• 膜活性抗菌多肽的结构、相互作用与组装 (上)
  • amp_chemical_reviews_B
  • amp_chemical_reviews_C

JMC

• 药物发现中的匹配分子对分析方法与最新应用

2025

Chemical Reviews

• 难以成药靶标的计算机辅助药物发现

Nat. Rev. Chem.

• 从发现到临床的PROTAC连接子设计经验总结

Acc. Chem. Res.

• ASKCOS：开源的数据驱动合成规划
• 人工智能驱动的抗菌肽发现：挖掘与生成

Chemical Science

• 针对化学领域中数据不平衡问题的机器学习方法综述

J. Med. Chem.

• 抗体−药物偶联物中肽连接子的最新进展
• 肽–药物偶联物治疗效能增强的最新进展

European Journal of Medicinal Chemistry

• 药物化学中的环系统：药物发现过程中环结构流行度随时间变化的化学信息学分析

Nat. Chem. Biol.

• 利用计算技术推动抗体–药物偶联物的开发

2024

Signal Transduction and Targeted Therapy.

• G蛋白偶联受体(GPCRs):结构、机制与药物发现的最新进展

WIREs Comput. Mol. Sci.

• 扩散模型在蛋白质和对接中的应用

Acc. Chem. Res.

• 利用深度学习推进配体对接: 虚拟筛选中的挑战与前景

2023

Biomedicine & Pharmacotherapy

• 深度学习在单细胞基因组学与转录组学数据分析中的应用

2022

BioDesign Research

• 用于结合蛋白靶标的蛋白片段与肽的设计

2021

Chemical Science

• 蛋白质−蛋白质相互作用肽类抑制剂：引入构象约束后的生物物理、结构与细胞学影响

Others

Annual Review of Pharmacology and Toxicology

• 受体别构位点的药物

Nature Reviews Immunology

• 对MHCⅠ类和MHCⅡ类抗原呈递的系统性理解